Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS6KL1Q9Y6S9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1Q9Y6S9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms