Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms