Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC6Q9Y625 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms