Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAD54BQ9Y620 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAD54BQ9Y620 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms