Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNX11Q9Y5W9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX11Q9Y5W9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX11Q9Y5W9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms