Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX13Q9Y5W8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX13Q9Y5W8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms