Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL3Q9Y4R7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL3Q9Y4R7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms