Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF6Q9Y4K3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms