Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
AP3M1Q9Y2T2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M1Q9Y2T2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms