Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL20Q9Y2M5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL20Q9Y2M5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms