Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP18Q9UMW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP18Q9UMW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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