Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MBD1Q9UIS9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD1Q9UIS9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD1Q9UIS9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms