Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIP2Q9UDT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLIP2Q9UDT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms