Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APEX2Q9UBZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APEX2Q9UBZ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms