Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
XCL2Q9UBD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
XCL2Q9UBD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms