Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FRMD4AQ9P2Q2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMD4AQ9P2Q2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD4AQ9P2Q2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMD4AQ9P2Q2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms