Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGFRNQ9P2B2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTGFRNQ9P2B2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms