Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SENP1Q9P0U3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SENP1Q9P0U3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms