Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIN1Q9NXP7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIN1Q9NXP7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIN1Q9NXP7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms