Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RLIMQ9NVW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RLIMQ9NVW2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms