Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EMILIN3Q9NT22 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EMILIN3Q9NT22 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMILIN3Q9NT22 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms