Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNIP2Q9NS61 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNIP2Q9NS61 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms