Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VPS45Q9NRW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VPS45Q9NRW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms