Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGEF3Q9NR81 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGEF3Q9NR81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms