Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL1Q9NR64 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL1Q9NR64 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms