Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX9Q9NQ69 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LHX9Q9NQ69 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHX9Q9NQ69 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms