Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TIMMDC1Q9NPL8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms