Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FANCFQ9NPI8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FANCFQ9NPI8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FANCFQ9NPI8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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