Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NGRNQ9NPE2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NGRNQ9NPE2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms