Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCNB1IP1Q9NPC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms