Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD248Q9HCU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD248Q9HCU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms