Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMURF1Q9HCE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMURF1Q9HCE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMURF1Q9HCE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms