Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4AQ9H3S1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4AQ9H3S1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms