Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG10Q9H0Y0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG10Q9H0Y0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG10Q9H0Y0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms