Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR3CQ9C0K3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR3CQ9C0K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms