Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-205ENST00000466642 1023 ntTSL 420.05■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-214ENST00000483108 598 ntTSL 418.68■□□□□ 0.586e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-217ENST00000484142 553 ntTSL 418.68■□□□□ 0.586e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-206ENST00000467400 717 ntTSL 518.06■□□□□ 0.486e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.226e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 CHD6-209ENST00000482596 599 ntTSL 1 (best)8.22□□□□□ -1.091e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 521.49■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.162e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.052e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 DDX42-212ENST00000581135 589 ntTSL 418.6■□□□□ 0.572e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 YWHAB-207ENST00000631616 5867 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.564e-8■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 YWHAB-203ENST00000428262 648 ntTSL 318.5■□□□□ 0.554e-8■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-8■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-8■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 YWHAB-204ENST00000445830 556 ntTSL 213.87□□□□□ -0.194e-8■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 YWHAB-206ENST00000479421 1097 ntTSL 512.62□□□□□ -0.394e-8■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.113e-7■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.913e-7■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 NCL-205ENST00000453992 964 ntTSL 421.66■■□□□ 1.067e-13■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 37.77□□□□□ -1.177e-13■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 47.77□□□□□ -1.177e-13■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 NCL-204ENST00000436894 562 ntTSL 45.17□□□□□ -1.587e-13■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 OAZ1-203ENST00000586054 2832 nt23.92■■□□□ 1.424e-24■■■□□ 15.8
FTOQ9C0B1 FGD5-AS1-201ENST00000417835 1630 ntTSL 1 (best)27.32■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.892e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.728e-10■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.568e-10■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 FGD5-AS1-203ENST00000426200 1874 ntTSL 1 (best)24.62■■□□□ 1.532e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ABHD16A-216ENST00000498420 1137 ntTSL 524.28■■□□□ 1.484e-9■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 RCN2-204ENST00000557805 691 ntTSL 323.87■■□□□ 1.418e-10■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ABHD16A-214ENST00000495769 1892 ntTSL 522.44■■□□□ 1.184e-9■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.162e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 C1QBP-204ENST00000573406 767 ntTSL 222.31■■□□□ 1.162e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 FGD5-AS1-205ENST00000440079 1527 ntTSL 1 (best)20.99■□□□□ 0.952e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ABHD16A-209ENST00000477462 582 ntTSL 319.93■□□□□ 0.784e-9■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ABHD16A-210ENST00000482224 864 ntTSL 219.62■□□□□ 0.734e-9■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.54e-9■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.298e-10■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.234e-9■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 311.77□□□□□ -0.532e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-14■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ZNF146-204ENST00000587285 571 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.912e-14■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 29.34□□□□□ -0.912e-14■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 C1QBP-207ENST00000576122 383 ntTSL 37.18□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.292e-14■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 24.49□□□□□ -1.692e-14■■■□□ 15.7
FTOQ9C0B1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.586e-12■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 532.48■■■□□ 2.796e-12■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 320.89■□□□□ 0.946e-12■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.776e-12■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 NFE2L1-219ENST00000584137 529 ntTSL 426.38■■□□□ 1.816e-9■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 NFE2L1-209ENST00000579889 568 ntTSL 314.83□□□□□ -0.046e-9■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.056e-9■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.176e-9■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.446e-9■■■□□ 15.6
FTOQ9C0B1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.375e-7■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.045e-7■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■□□ 15.5
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FTOQ9C0B1 AP3D1-212ENST00000592488 707 ntTSL 319.27■□□□□ 0.683e-8■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.054e-13■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.944e-13■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.162e-15■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 OXSR1-202ENST00000426620 1581 ntTSL 1 (best)28.34■■■□□ 2.132e-15■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 OXSR1-206ENST00000492714 471 ntTSL 323.86■■□□□ 1.412e-15■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-15■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 328.55■■■□□ 2.161e-7■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 323.89■■□□□ 1.411e-7■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.332e-9■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.042e-9■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-9■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 216.29■□□□□ 0.22e-9■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 324.1■■□□□ 1.454e-13■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 CALR-205ENST00000587486 957 ntTSL 218.93■□□□□ 0.624e-13■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-13■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 211.65□□□□□ -0.544e-13■■■□□ 15.5
FTOQ9C0B1 CNOT6-206ENST00000510148 456 ntTSL 428.84■■■□□ 2.218e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 UBE2K-207ENST00000513231 871 ntTSL 1 (best)27.37■■□□□ 1.978e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 CNOT6-205ENST00000507016 382 ntTSL 326.99■■□□□ 1.918e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 324.19■■□□□ 1.468e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 524.12■■□□□ 1.458e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 223.69■■□□□ 1.388e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.388e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.348e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.228e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 AGAP3-219ENST00000485904 683 ntTSL 322.53■■□□□ 1.28e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 222.42■■□□□ 1.188e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.178e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 522.03■■□□□ 1.128e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.038e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.028e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.978e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.968e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 521.03■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 15.4
FTOQ9C0B1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.928e-6■■■□□ 15.4
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