Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM7Q9C029 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM7Q9C029 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms