Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM8Q9BZR9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM8Q9BZR9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms