Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM55Q9BYV6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM55Q9BYV6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms