Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC11CQ9BY50 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC11CQ9BY50 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC11CQ9BY50 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC11CQ9BY50 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC11CQ9BY50 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEC11CQ9BY50 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEC11CQ9BY50 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms