Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL3Q9BXA9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SALL3Q9BXA9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL3Q9BXA9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL3Q9BXA9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms