Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRAIPQ9BWF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAIPQ9BWF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAIPQ9BWF2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms