Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KATNB1Q9BVA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KATNB1Q9BVA0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms