Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD7Q9BUK0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHCHD7Q9BUK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHCHD7Q9BUK0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms