Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB6Q9BUF5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms