Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFAF3Q9BU61 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NDUFAF3Q9BU61 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms