Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UPK3BQ9BT76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UPK3BQ9BT76 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UPK3BQ9BT76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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