Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN18Q99952 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN18Q99952 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN18Q99952 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms