Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGMNQ99538 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGMNQ99538 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGMNQ99538 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 761.7 ms