Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UHRF1Q96T88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UHRF1Q96T88 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UHRF1Q96T88 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 529.6 ms